(Из  http://vovam.livejournal.com/4509.html с сокращениями.)

Рост использования словосочетания pair-trading в академической литературе начинается именно в 1998-1999, до этого и в районе этой даты, по смыслу близкие статьи кружили вокруг relative value  и market neutral long-short (хотя по смыслу уже искали пары, корзины пар и тп - заходов на эту тему было много и с разных сторон, например со стороны оптимальных портфелей а-ля Марковица и вопроса их перебалансировки, или перебалансировки оптимальных индексов).
Типа:
- Jacobs, B., K. Levy and D. Starer, 1998, On the Optimality of Long-Short Strategies”, Financial Analysts Journal, Vol. 54(2), pp. 40-50 http://www.jlem.com/articles/jlem/optimalityLs.pdf
- Alexander, C. and A. Dimitriu, 2002, The Cointegration Alpha: Enhanced Index Tracking and Long-Short
Equity Market Neutral Strategies, working paper 
http://papers.ssrn.com/sol3/papers.cfm?abstract_id=315619Впоследствии модность словосочетания "Long-Short" стала падать, уступив cловам "neutral","pairs trading", а позднее "cointegrated"